Вы находитесь на старом сайте НГУ. Перейти на новый сайт


С 23 по 27 ноября 2015 года состоится школа молодых ученых "Компьютерное моделирование структуры и динамики биомолекул".

Компьютерная биология стремительно развивается на стыке естественных наук и информационных технологий. Моделирование и анализ структуры и динамики белков и других биомолекул - одно из наиболее интересных направлений компьютерной биологии, помогающее решать множество важных задач. Школа предназначена и для биологов, желающих овладеть новыми методами исследований, и для математиков и программистов, которые хотели бы применить свой опыт в актуальной области. От участников Школы не потребуется специальных знаний в области моделирования биомолекул.

Работа Школы начнется 23 ноября с вводных занятий. До обеда пройдут лекции по биологии для участников не биологических специальностей. Лекции после обеда затронут вопросы строения белка с точки зрения физики и правильной организации научной работы. Для тех, кто неуверенно чувствуют себя при работе с операционной системой Linux, вечером будет проведен практикум.

Во вторник, 24 ноября, состоится торжественное открытие Школы, пройдут лекции и практические занятия по моделированию белков по гомологии. Будет проведен практикум по работе с программой просмотра и анализа структур биомолекул Chimera. Участники Школы смогут поработать с реальными задачами по созданию моделей или изображений белков, в том числе и с собственными. Вечером участников ждет фуршет и неформальное общение.

В среду, 25 ноября, будут лекции по молекулярной динамике и докингу биомолекул, как по общим принципам, так и с примерами решения конкретных научных задач, и практикум по молекулярной динамике c использованием пакета Gromacs. Во второй половине дня будет экскурсия в Центр молодежного инновационного творчества Zoomer новосибирского Технопарка. Там специалисты Центра продемонстрируют оборудование для 3D-печати и примеры изделий, прочитают лекцию о технологиях 3D-печати и практических аспектах подготовки файлов для печати моделей биомолекул. По предварительной договоренности можно будет запустить печать своих моделей.

В четверг, 26 ноября, будет рассказано о современном состоянии и перспективах моделирования фолдинга белка. Лекции прочитают передовые ученые в области исследования фолдинга, работавшие с лауреатом Нобелевской премии Мартином Карплусом. Затем начнутся лекции по структурной биоинформатике и анализу первичной структуры белков с использованием методов машинного обучения.

В пятницу, 27 ноября, участники смогут сделать доклады о своих работах, в том числе и о тех, которые были выполнены во время Школы. Вечером состоится закрытие Школы.

Программа Школы: скачать

Регистрация окончена. Незарегистрированные участники могут посещать лекции.
Предполагается, что участники будут использовать собственные ноутбуки на практических занятиях. Допускается любая операционная система на ноутбуках. Во время практикума по линуксу работа будет проводиться на удаленном сервере.
Наличие доклада для участников школы не обязательно, но очень желательно, в том числе и для тех, у кого еще нет завершенного проекта по теме Школы. Это уникальная возможность обменяться опытом и получить полезные рекомендации по дальнейшей работе.

Last edit: 22.11.2015 22:23