The purpose of this study is an assessment of the genetic diversity of Neisseria gonorrhoeae isolates from different Russian cities by VNTR-typing and search of the associations between certain groups of isolates and the presence of drug resistance. VNTR-typing technique included a separate amplification of each of the seven VNTR-loci and subsequent separation of the PCR products on a polyacrylamide gel. In total, 83 VNTR types were identified for 218 Neisseria gonorrhoeae isolates, including 47 unique VNTR types that were presented by one isolate, and other VNTR types that contained from two to ten isolates. VNTR type 16 was the most widespread and was associated with multidrug resistance, as well as closely related VNTR-types 17 and 21. Six clusters were found and the associations between the cluster A and resistant to ciprofloxacin and tetracycline, cluster D and resistance to penicillin, clusters B, C and E and susceptibility to ciprofloxacin were shown. Thus, the method of VNTR typing has a high discriminatory power and may be useful for epidemiological studies of gonococcal infections.
Проведено исследование генетического разнообразия изолятов Neisseria gonorrhoeae из разных городов России методом VNTR-типирования, а также поиск ассоциации между принадлежностью изолятов к определенным группам и наличием лекарственной устойчивости. Методика VNTR-типирования включала отдельную амплификацию каждого из семи VNTR-локусов и последующее разделение продуктов ПЦР в полиакриламидном геле. Обнаружено 83 VNTR-типа для 218 изолятов N. gonorrhoeae, среди них 47 уникальных VNTR-типов, представленных одним изолятом, остальные VNTR-типы включали от двух до десяти изолятов. Тип VNTR-16 оказался наиболее распространенным и ассоциирован с множественной лекарственной устойчивостью, как и близкие к нему VNTR-типы 17 и 21. Выделено шесть кластеров и показано наличие ассоциации между принадлежностью изолятов к кластеру A и устойчивостью к ципрофлоксацину и тетрациклину, к кластеру D и устойчивостью к пенициллину, к кластерам B, C и E и чувствительностью к ципрофлоксацину. Таким образом, метод VNTR-типирования обладает высокой дискриминирующей способностью и может быть полезен для эпидемиологических исследований гонококковых инфекций.
