Карта карьеры студента НГУ

Другие названия профессии: информационный биолог

Биоинформатики используют синтез подходов программирования, математической статистики и машинного обучения для анализа и интеграции медико-биологических данных. Специалисты пишут код для очень узких и строго специфичных задач, учитывая свойства биологических систем. Востребованы в таких отраслях, как биология, медицина, сельское хозяйство, здравоохранение, экология

Базовые требования

высшее биологическое образование
знание языков программирования, преимущественно Python, R; в зависимости от задач: Java, JavaScript, C++
знание основ математической статистики, машинного обучения

Типичные задачи

Сборка и функциональная аннотация генома/ транскриптома
Разработка алгоритмов для анализа данных NGS (WES, WGS, RNAseq, scRNAseq, Methyl-seq)
Разработка алгоритмов для предсказания пространственной структуры белков (структурная биоинформатика), в т.ч. для создания лекарств создание компьютерных моделей популяций для предсказания поведение системы во времени, изучение эволюции организмов (вычислительная эволюционная биология)
Data mining
Написание научных статей, документации к пайплайнам

Карьерный трек

Должность junior - Младший биоинформатик

Средняя зарплата:30 000 — 70 000 руб.

Требования к опыту работы: без опыта или стажировка

Ключевые требования: высшее (или выпускной курс) образование; владение языком программирования R или Python; умение писать простые скрипты; умение работать в командной строке; уровень английского не ниже Intermediate; знание основ математической статистики

Ключевые задачи/характеристики работы:

Сборка геномов/ транскриптомов, дальнейшая функциональная аннотация
Анализ дифференциальной экспрессии генов
Проведения филогенетического анализа
Работа с научными базами данных
Работа с данными генотипирования
Написание отчётов

Должность middle - Биоинформатик

Средняя зарплата: 60 000 — 130 000 руб.

Требования к опыту работы:от 1 года

Ключевые требования: Обработка NGS-данных и поиск новых подходов для их анализа (например, анализ данных scRNA-seq (Seurat, Scanpy)) Интерпретация данных клинического секвенирования (экзомы, панели генов, полные геномы, молекулярное кариотипирование) (характерно для работы клиническим биоинформатиком) Разработка биоинформатических пайплайнов, написание документации к пайплайнам Написание научных публикаций

Ключевые задачи/характеристики работы:

Обработка NGS-данных и поиск новых подходов для их анализа (например, анализ данных scRNA-seq (Seurat, Scanpy))
Интерпретация данных клинического секвенирования (экзомы, панели генов, полные геномы, молекулярное кариотипирование) (характерно для работы клиническим биоинформатиком)
Разработка биоинформатических пайплайнов, написание документации к пайплайнам
Написание научных публикаций

Должность senior - Старший биоинформатик

Средняя зарплата: от 100 000 руб.

Требования к опыту работы: от 3-6 лет

Ключевые требования:высшее биологическое образование, опыт работы с реляционными базами данных, знание языка SQL; опыт работы с системами контроля версий (git); опыт работы с Docker/Singularity; Python: ООП, scikit-learn, Pytorch; коммерческий или научный опыт разработки ПО; уровень английского Upper-Intermediate

Ключевые задачи/характеристики работы:

Обработка NGS-данных и поиск новых подходов для их анализа (WES, WGS, RNAseq, scRNAseq, Methyl-seq)
Руководство командой в рамках вверенных проектов: организация и контроль выполнения поставленных задач, решение возникающих вопросов
Участие в переговорах с индустриальными партнерами и дальнейшая коммуникация по исследованиям
Наставничество, обмен знаниями с сотрудниками в области биоинформатики и машинного обучения