Сетевой университет СНГ (СУ СНГ) - консорциум под эгидой РУДН, разрабатывающий и реализующий программы, аналогичные Erasmus Mundus, в рамках единого образовательного пространства государств-участников СНГ; НГУ принимает студентов по направлениям «экономика» и «менеджмент»
Университет Шанхайской организации сотрудничества (УШОС) - международная площадка подготовки кадров высшей квалификации по приоритетным областям сотрудничества стран-участниц ШОС; НГУ является ведущим вузом по направлениям «экономика» и «IT-технологии» и площадкой Форумов ШОС
Китайско-российский институт совместно с Хэйлунцзянским университетом (с 2010 г., около 800 студентов в год)
Центр русского языка в Синьцзянском университете (с 2011 г., около 400 студентов в год)
Центр русского языка Карамайского профессионально-технического института (с 2012 г., около 200 студентов в год)
Китайско-российская школа в г. Карамай - совместно с СУНЦ НГУ (с 2014 г., около 60 студентов в год)
29 совместных образовательных программ реализуется в НГУ
более 100 студентов ежегодно принимают участие в программах обмена
Альянс-Франсез Новосибирск - один из 13 центров французского языка и культуры, действующих в России при поддержке Международного Фонда Альянс Франсез; партнер Французского центра НГУ
АО «Фонд национального благосостояния Самрук-Казына» - правительственный фонд по управлению ключевыми национальными компаниями Казахстана; НГУ разрабатывает проект совместного Центра технологических инициатив
ОФ Единство - общественный фонд Кыргызстана, содействующий развитию кадрового потенциала для основных отраслей экономики страны; НГУ ведёт совместную работу по привлечению талантливых абитуриентов
Ханьбань (Штаб-квартира Институтов Конфуция) - правительственная организация КНР по распространению китайского языка и культуры за рубежом; при поддержке Ханьбань и Синьцзянского университета в НГУ действует научно-образовательный и культурный центр «Институт Конфуция»
Японский фонд - независимая административная организация по продвижению японского языка, японистики и культурных обменов; преподаватели фонда работают на отделении востоковедения Гуманитарного института НГУ
Ассоциация образовательных организаций высшего образования «Глобальные университеты» - лидеры российского высшего образования, объединившиеся в рамках проекта 5-100
Ассоциация университетов Франкофонии (AUF) - крупнейшая франкоязычная международная ассоциация (817 университетов, высших школ, научно-исследовательских и образовательных центров из более чем 100 стран мира); НГУ вместе с другими вузами Сибири участвует в научных и образовательных проектах французских академических организаций
Ассоциация иностранных студентов (АИС) - главная организация иностранных студентов России с действующим при поддержке НГУ филиалом в Новосибирске
Евразийская ассоциация университетов (ЕАУ) - объединение университетов стран СНГ под эгидой МГУ в целях развития единого образовательного пространства и сотрудничества университетов